故事起源于1291年艾可地區（Acre）的圣耶路撒冷（Holy Land）。這一年，伊斯蘭領袖蘇丹親率大軍攻伐拉丁王國（Latin Kingdom，由東征的十字軍于1100年建立），拉丁王國陷落，城市也隨之土崩瓦解。激戰中，來自法國Carmaux的年輕騎士Martin奉圣殿騎士團最高領袖的命令，帶著自己的老師Aimard和一個神秘的箱子，偷偷乘一葉扁舟逃入大海。但是這艘小船沒能抵擋住大海的狂暴，從此杳無音訊。
　　故事很快跳轉到現代都市紐約。大都會博物館正在為 \"梵蒂岡珍寶展\" 舉辦一場熱鬧的揭幕晚會，突然有四個人騎馬沖進大廳。他們清一色圣殿騎士的穿著打扮，還戴著面具，人們頓時驚慌失措、亂作一團。正在現場的Tess觀察到一個細節－－當為首的騎士神秘消失在紐約中央公園時，手里緊緊攥著一個剛剛從博物館搶來的奇怪裝置。
　　不久之后，這些 \"騎士\" 的尸體被人發現，那個裝置則不知下落。很顯然，這東西相當重要，FBI于是派精銳特工Daley協助Tess調查此案。他們發現，十字軍騎士團中隱藏著一段不為人知的黑暗歷史，那個叫Martin的騎士是最后一名幸存的圣殿騎士，他離開圣城時帶著一項絕密任務。為了弄清真相，兩人穿越曼哈頓的墓地和下水道，跨越美歐亞大陸，闖進荒涼的土耳其高原……地中海上，他們乘坐的船只遭遇暴風襲擊，被迫流落到一個荒無人煙的希臘小島。他們離梵蒂岡秘密的中心越來越近，但是危險也隨之而來……