在一列從東京開往大除夕阪的特快列車上，坐著一位高貴而特另外主人。她是來自歐洲英格拉姆帝國女王莎莉貝絲，隨行的另有其年幼的兒子菲利浦王子。女王擁有一顆歐洲最大除夕的寶石——水晶之母，這也惹起了怪盜基德的屬意。為了克制基德得手，女王身邊部署大除夕批保鏢跟警力。中森警官是島國警方的總代表，而他的女兒青子以及基德的真身快斗也同在這列火車之上。眼看離預準韶光越來越近，快斗卻一直不找到寶石真正的躲匿所在。與此同時，國際寶石大除夕盜杰卡爾跟羅絲也尾隨前來，他們企圖在基德得手之際乘虛而進。同在火車上的柯南從假冒成乘務員的羅絲身上看出蹊蹺。一場寶石的攻防戰破即開展……...