數年前，人類以超等戰艦“轟天號”，在南極擊潰“哥吉拉”，并且將“哥吉拉”封印在地底下。但是地球除了“哥吉拉”以外，另有許許多多的怪獸，對各大除夕人類都市虎視眈眈。于是，人類創建了“地球防守部”，專門對于種種怪獸的進侵。而地球防守部最富強除夕的成員，就是當年封印哥吉拉的“轟天號”以及其艦長“道格拉斯·戈登上校”。別的，為了唐塞怪獸對人類形成的困擾，地球防守部迥殊甄選了有迥殊才華的人類，這些“超人類”擁有一般人類所不的“M染色體”，讓這些人類擁有比一般人更富強除夕的體能跟敏捷性，以唐塞怪獸的進擊，此中的佼佼者就是“尾崎真一少尉”。就在未多少之前，人們挖到一個偉大除夕怪物的遺骸，并且怪物領無機器跟生物的素質，猜忌大略大略將生物跟機器結合起來的怪物該當來自于外太空。未多少，尾崎真一收到來自嬰兒島“小尤物”的勸誡，這個怪物是當年被“魔斯拉”給封印的“蓋剛”，蓋剛的呈當代表著人類......