那裡是能夠映照出耀目陽光的海底，是以人類姿態並且純潔無垢的少女、跟魚類共同生活的地方。名為瑪琳女孩，是居住在海的世界裡，跟妹妹烏琳一樣對空之世界充滿憧憬的海人。

有一天，一隻美麗的戒指落入海的世界裡。瑪琳和烏琳兩姐妹為了把戒指交還給原本的擁有者而初次離開了海的世界。

兩人好不容易的來到了一個周邊被海所包圍的小島。有一位名叫夏音的女子高中生在這個在小島上生活著。她是一名性格陰暗的少女，之前被男朋友法蘭欺騙，現在對日常生活均不抱任何希望。而事實上夏音正是瑪琳她們在尋找的戒指的主人。因命叨�相遇的瑪琳和夏音，不久後隱藏在兩人體內的神秘力量覺醒了。

化身為“海之巫女”和“空之巫女”的瑪琳和夏音，對覆蓋世界的“黑暗”展開挑戰……