森田病院院長森田健叁的女兒由美，因為父親突然失蹤，四出搜索，發現不單父親行蹤不明，連醫院內之醫生和護士亦相繼消失。由美偶然間認識了剛巧入院的大學生佐藤文，兩人合力研究，誓要解開事件疑團，終於知道整件事是由一個少女而起的。在森田健叁失蹤前數天，少女因急病被送入院，令醫生與護士們吃驚的，是剖開少女腹部，竟是一個活生生的人頭！
手術過程驚心動魄，手術過後就發生眾人行情不明事件。而在森田健叁的筆記內，不斷有「富江」這個名字出現。謎團逐步揭開，原來健叁在病院的低層，特別用水缸培養及觀察人頭，一切噩夢，卻由此而起！一個恐怖頭顱，竟能繁殖出一個殺人不眨眼的魔女富江，令生人膽喪，災難一發不可收拾……
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