在一次戰鬥後，光太郎發現自己變回了BLACK，而且三神官也出現在自己的面前。原來，克萊西斯帝國為了消滅BLACK RX，便想辦法讓RX變回以前力量不怎麼強大的BLACK，並藉機消滅他。正當BLACK將要被三神官殺死的時侯，另一個BLACK RX出手相救。眼見消滅BLACK不成的克萊西斯派出了大量怪人追殺BLACK和BLACK RX，正當兩人不敵的時侯，機械騎士和生化騎士相繼出現相助。在消滅所有的怪人後，四人重新融合回一個BLACK RX