2010年，小學教員市川新市（哀川翔飾）變身斑馬人，打敗了前來入侵的外星人，成為全人類的偶像。但在此之後，市川卻神秘消失，行踪不明。轉眼15年過去，日本發生巨大的改變。正邪顛倒，罪惡橫行。東京更名斑馬城，每天都有5分鐘被稱為“斑馬時間”。是時，全副武裝的斑馬警察傾巢出動，對仍滯留街上的市民展開毫不留情的大屠殺。邪惡的相原公藏（ガダルカナル·タカ飾）和她的女兒斑馬皇后（仲裡依紗飾）統治著這裡，在其強大的暴力陰影下，從者眾而逆者寡。
　　某天，專門收容被斑馬警察傷害的白馬之家迎來了一位不尋常的病人。他就是消失15年之久的市川，但他對從前的事情一概不知。市川的學生晉平（井上正大飾）和夥伴們悉心照料著他，希望市川早日恢復斑馬人的英姿，帶人民脫離苦海……