諜戰深海描述了港口城市海昌，是一個以海洋科技為先導迅速發展起來的新興沿海城市，這里不但是我國走向海洋的前沿陣地，也是境外間諜組織密切關注的焦點…… 　　海昌市國家安全局一名偵查員在執行任務時失蹤，引起了省廳高度重視，李廳長指派經驗豐富的武梅率專案組赴海昌追查事件真相：敵我雙方的較量隨即在出海測試的“探索一號”工作船上展開…… 　　不久，一艘漁船在“探索一號”工作船的測試海域意外打撈起一個神秘的海底裝置——“水母”。深海研究員立即組成以副總工程師岳諡槭椎目蒲行〗M，對該裝置進行破解。境外間諜組織頭目彼得森獲悉“水母”丟失后，緊急責令潛伏海昌多年的海洋俱樂部總經理王維韜，不惜一切代價奪回“水母”芯片。 　　專案組在挫敗了間諜組織的一系列行動，諜戰深海抓獲海昌間諜組織骨干王維韜，但武梅發現事件背后隱藏著一個更加諜戰深海令人震驚的陰帧�—水母計劃，境外間諜組織已將多枚“水母”投放到我國海域，目的是竊取我國海洋信息環境與資源信息諜戰深海，而執行“水母計劃”諜戰深海的“釣魚者”身份神秘。 　　武梅抽絲剝繭耐心偵察，終于迫使“釣魚者”原形畢露，雙方隨即展開了生死較量。最終，武梅率領專案組查獲了“水母”的秘密測試廠、搗毀了信號傳輸基站，“釣魚者”落網諜戰深海，“水母計劃”徹底破產……